De conformidad con el artículo 194 de la Ley 100 de 1993, el gobierno nacional expide el Decreto 1288 de 1994, por el cual la entidad Sanatorio de Agua de Dios se transforma en Empresa Social del Estado “E.S.E.”, como una entidad pública descentralizada del orden nacional, de naturaleza especial, con personería jurídica, patrimonio propio y autonomía administrativa, integrante del Sistema General de Seguridad Social en Salud, adscrita al Ministerio de Salud y Protección Social. Tiene como objeto social la especial prestación del servicio de salud a cargo del Estado, a los enfermos de Hansen y sus convivientes y a la comunidad en general, y especialmente, la administración de los 3 Albergues dispuestos para la habitación de pacientes que pertenecen al programa Hansen y l administración de los recursos que se giran mensualmente por efecto del subsidio por la enfermedad de Hansen.